16世紀末葉由藏傳佛教寧瑪派著名喇嘛強達·紮西度傑興建，是第二世仁增欽波·昂格旺波後歷世仁增欽波的座寺。該寺為寧瑪派在西藏的重要寺院之壹，與敏珠林寺齊名。公元1718年蒙古準噶爾部軍隊侵擾西藏期間，寺院建築遭到嚴重破壞，後來加以重修進而興盛，分寺遍及整個藏區，其教流傳承至今。

 

    該寺顯密佛法並重，尼瑪派教法之遠傳佛語部傳承自成壹派；伏藏部中主修北傳伏藏，兼修白瑪列哲哉、甲相崇、強達·紮西度傑等掘藏師的伏藏，匯集有五十多卷；凈相部中專修五世達賴及五世仁增欽波等的凈相密法。

 

    多吉紮寺是寧瑪派在前藏的主要寺院之壹。寧瑪派是藏傳佛教各教派中歷史最久過錯的壹派，現任寺主為仁增欽摩·多傑紮·江白洛桑活佛，是西藏自治區政協副主席、中國佛教協會副會長。

 

    多吉紮寺以傳授北藏系統為主，附帶也傳授三素爾以來的壹些佛教經典。寧瑪派經典中的重要部分是伏藏，伏藏是從山洞或地下發掘出來的經典。約在十二世紀時，寧瑪派中就先後出現了挖掘伏藏的人，他們被稱為德敦。其中著名的有娘·尼瑪維色，他發掘的伏藏稱為上部伏藏∶古如·曲吉秋發掘的伏藏稱為下部伏藏。在十五至十六世紀時，挖掘伏藏的熱特那林巴將上下部伏藏和自己挖掘的伏藏匯集壹起刻印，稱為南藏；十六世紀前期，後藏昂仁縣日吾紮桑地方的壹個貴族子弟仁增·敦吉登曲堅贊發掘出不少伏藏並刻印，稱為北藏；北藏中有很多經籍都是原來經典和伏藏中所沒有的，如《堪卓寧提》等，在這些伏藏中，有講寧瑪派傳承的，有講醫學的，有講吐蕃王朝時期歷史的，其中較著名的有《五部遺教》、《蓮花生遺教》等，對研究吐蕃歷史有壹定的參考價值。多吉紮寺專門弘傳北藏系統的密乘經典，並認定仁增欽摩·敦吉登曲堅贊為該寺的第壹世活佛。

 

    寧瑪派作為壹個教派，它不像薩迦、噶舉等其他教派，壹直有壹個中心寺院，而寧瑪派卻是分散發展的，也不像其他的教派那樣和地方勢力有比較密切的關系。寧瑪派在元朝雖然和中央政權建立了聯系，但由於寧瑪派組織渙散，單線傳承，故始終未形成壹個穩定的寺廟集團勢力。直到十六世紀，在前藏才出現了較有規模的寧瑪派寺院。特別是十七世紀由於第五世達賴的支援，寧瑪派在前藏的兩座著名寺院（即∶敏珠林寺、多吉紮寺）才有了顯著的擴展，第五世達賴還專門興建了壹座寺院（南傑林寺）弘傳寧瑪派教法。壹七壹八年準噶爾蒙古軍隊侵擾西藏，多吉紮寺被摧毀，寺主仁增欽摩·白瑪逞勒活佛等人被害。後由頗羅鼐地方政府資助修復。文革中又慘遭破壞，壹九八四年政府撥專款進行了修復，現有喇嘛二十三人。

多吉紮寺供奉的神像奇特，主要有出世五部為修道成佛必須的本尊，有代表身語意的文殊、蓮花、真實，代表功德和事業的甘露、金剛橛；世間三部為差遣非人、兇猛咒詛、供贊世神。非人原是西藏本教中的兇神，藏語稱瑪摩後被寧瑪派吸收為護法神。其形象被描繪成黑色的既醜又忿怒的婦人，半裸，乾癟的乳房，結塊的發辮；典型的兵器是疫病口袋、拘鬼牌、黑繩套和魔線球。最著名的護法女神是班丹拉姆，她是眾瑪摩之主。