貢巴孜寺始建於1420年，創寺人為門巴族-丹巴嘉措（邦欽學布贊村人），前後傳承十五代-。

　　貢巴孜寺原建築面積達18000平方米（東西長150米，南北寬120米），規模宏大。各建築群依山勢起伏由南至北呈梯裝伸展，外圍有高大的院墻，用片石疊砌，平面呈不規則梯形，北窄南寬，墻體高2～2.5米，厚0.6～1米；圍墻的東、南、西、北三面門道，現存東、南、西三面門道，其中南面為寺廟正門，砌有東西向的數級石階，寬約4米。

　　貢巴孜寺由南向北由三組建築群構成寺廟的主體：第壹組建築由前庭、曲康、絨康（夥房）等構成。其中曲康面積為4柱，內供各0神像；第二組建築緊鄰前庭之北側，由杜康（-堂）及東、西兩側的貢康、拉姆組成。杜康是全寺講經-的宗教活動中心，面積為16柱，高4層，門辟於南面，殿內原主供強巴佛銅像，高約兩層樓（8～10米）。杜康西介為兩層樓（8～10米）。杜康西側為貢康（護法神殿），面積為2柱，主供大威德明王。貢康西側是拉姆康，面積亦為2柱，殿內主供0神吉祥天女。在杜康大殿的上層分別置有拉康（佛殿）與倉庫等。杜康大殿東北角為該寺第十四代堪布土登強巴夏日的居所，面積為1柱；第三組建築位於寺齋的最北端，由經堂、卓康和附屬建築構成。卓康坐北朝南，東面壁門，門上飾桃形護鐵兩道。經堂面積約53平方米（南北長7.4米，東西寬7.2米），有柱4根，呈正方形。經堂內遍繪壁畫：西壁繪十六羅漢；南壁繪四大天王；北壁東側上面繪有宗喀巴、第五世達賴喇嘛（阿旺·羅桑嘉措）、毗盧遮那佛等像，下面繪有十六羅漢像，西側繪有護法神曲班拉姆；身騎白象，左手托寶幢，右手執火焰形桃符。

　　經堂北壁東端辟有側門通向後殿。後殿面積48平方米，有柱2根，四壁繪有壁畫，內容有釋迦牟尼、十六羅漢等像；北壁有佛櫥壹排，置有佛像。

　　卓康有東、西側房各2間：東側房北間為寺中-居室兼講經修習室，面積25平方米，有柱1根；南間為廳堂，面積48平方米（南北長8米，東西寬6米），有柱2根，用於僧侶拜見-或聽-講經說法；南面辟門。廳堂內遍繪壁畫：北壁西端繪有寺廟原建築全景圖，其上方為該寺-甘丹·娘熱巴掘渠引泉及-臺等畫面，頂部繪有神山嘎桑及本寺0神嘎桑像，騎灰馬，手持三叉戟；下方繪有錯那湖水及湖中蓮荷等圖。北壁東端繪有摩羯魚、寶輪、蓮花、法螺等圖案。東壁除繪有該寺歷代-消像及各類護法神像外，還有壹幅“藹見圖”，極富特色：畫上繪有來自印度、尼泊爾、漢地的使節及蒙、回等族的朝拜者群像，人物神態專註恭敬，服飾動作各異，由此反映出貢巴孜寺作為邊疆地區的宗教活動中心在歷史上曾占有顯著位置。

　　貢巴孜寺以卓康為主體的建築群是寺廟現存建築中最為完整的，殿堂墻體用片石壘砌而成，屋檐部壓蓋邊瑪草，外塗紅色，屋檐四角原有圓木雕獅各壹尊，現僅存東北角壹尊。原寺廟東部還有壹處建築叫“紮倉廈”，高二層，上層設倉庫及會議室，下層南側庭院為該寺重要宗教活動場所。寺廟墻外西側有壹護法神殿，面積1柱，主供護法神僅額有壹眼，怒目圓睜，面相猙獰。殿內珍藏有壹只野牛角，其上雕有龍、塔等精美圖案，據傳是甘丹·娘熱巴-修渠引泉時所用之法器。